Вика, если Вы планирует посетить другие страны Шенгена (не Эстонию), то им должно быть все равно, как Вы использовали эстонскую визу. Но если в Эстонию, то на усмотрение эстонцев, как ревностно они отнесутся к этому. Просто не понятно, куда Вы хотите получать новую визу. Нарушений действительно, нет. Думаю так. С уважением.